Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF1P30408 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms