Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms