Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms