Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
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