Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PLNP26678 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PLNP26678 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PLNP26678 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PLNP26678 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms