Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms