Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB1P14653 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms