Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms