Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEFHP12036 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEFHP12036 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEFHP12036 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEFHP12036 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEFHP12036 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms