Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms