Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTHFD1P11586 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms