Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI3P10071 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI3P10071 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI3P10071 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms