Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLI2P10070 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLI2P10070 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
GLI2P10070 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GLI2P10070 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI2P10070 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI2P10070 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms