Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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FAM200BP0CF97 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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FAM200BP0CF97 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FAM200BP0CF97 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FAM200BP0CF97 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM200BP0CF97 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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