Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47B1P0C2W7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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