Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFNA4P05014 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms