Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGAP02671 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGAP02671 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGAP02671 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGAP02671 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGAP02671 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGAP02671 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms