Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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