Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSD2O96028 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSD2O96028 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
NSD2O96028 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms