Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP19O94966 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP19O94966 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP19O94966 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP19O94966 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP19O94966 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms