Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFL1O94874 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFL1O94874 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFL1O94874 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFL1O94874 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms