Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLIT2O94813 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLIT2O94813 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms