Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms