Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms