Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN5O75503 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN5O75503 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN5O75503 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN5O75503 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms