Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM20BO75063 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms