Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTNBO60941 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTNBO60941 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTNBO60941 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTNBO60941 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTNBO60941 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms