Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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