Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNMO15061 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNMO15061 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYNMO15061 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNMO15061 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms