Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3EO15041 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms