Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9YO00507 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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