Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms