Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVH48-1M5A8F1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms