Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCER2I3L3R5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms