Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1D1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1D1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C1D1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C1D1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C1D1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C1D1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1D1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1D1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms