Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E9PBE3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9PBE3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9PBE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms