Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVV-2B6SEH9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms