Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-1B6SEH8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms