Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF804BA4D1E1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF804BA4D1E1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms