Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms