Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN16Q9Y5I7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms