Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms