Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC4Q9Y296 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms