Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCQ9Y266 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms