Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A2Q9UPR5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms