Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLEC4AQ9UMR7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms