Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms