Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms