Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms