Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBQLN2Q9UHD9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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